More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3468 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3468  DNA primase catalytic core domain protein  100 
 
 		 555 aa  1061    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  43.54 
 
 		 1836 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2356  DNA primase catalytic core-like  38.86 
 
 		 641 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0899243  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  38.28 
 
 		 656 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  37.88 
 
 		 1797 aa  161  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  35.07 
 
 		 616 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  37.34 
 
 		 623 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  37.42 
 
 		 642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  37.62 
 
 		 658 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  38.21 
 
 		 629 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  36.64 
 
 		 655 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  35.03 
 
 		 632 aa  151  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  35.06 
 
 		 700 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  38.49 
 
 		 624 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  35.86 
 
 		 616 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  35.94 
 
 		 645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.82 
 
 		 611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  36.27 
 
 		 636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  37.63 
 
 		 667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  33.68 
 
 		 601 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  34.71 
 
 		 627 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  35.41 
 
 		 634 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  34.03 
 
 		 576 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  36.58 
 
 		 628 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  33.82 
 
 		 592 aa  146  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  35.38 
 
 		 564 aa  146  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.53 
 
 		 604 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  33.33 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  25.87 
 
 		 600 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  35.16 
 
 		 656 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  30.84 
 
 		 601 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  34.6 
 
 		 660 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  32.64 
 
 		 573 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  34.28 
 
 		 577 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  33.33 
 
 		 660 aa  143  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  33.92 
 
 		 577 aa  143  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  143  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  37.1 
 
 		 651 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  35.6 
 
 		 644 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  33.68 
 
 		 574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  35.9 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  37.13 
 
 		 1967 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  33.33 
 
 		 575 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  31.17 
 
 		 576 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  32.99 
 
 		 574 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  37.05 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  35.91 
 
 		 1976 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  33.04 
 
 		 582 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  32.64 
 
 		 574 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  29.82 
 
 		 583 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.57 
 
 		 588 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  28.57 
 
 		 593 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  32.64 
 
 		 574 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  34.85 
 
 		 599 aa  137  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  33.69 
 
 		 655 aa  136  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  31.65 
 
 		 699 aa  136  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  26.1 
 
 		 595 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  27.95 
 
 		 595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.4 
 
 		 587 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  31.9 
 
 		 598 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  32.25 
 
 		 632 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  31.54 
 
 		 600 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  37.5 
 
 		 629 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  31.9 
 
 		 598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  31.54 
 
 		 598 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  31.54 
 
 		 598 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  31.54 
 
 		 598 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  33.66 
 
 		 601 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  31.54 
 
 		 598 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  31.54 
 
 		 598 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  36.11 
 
 		 619 aa  134  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2262  DNA primase  35.08 
 
 		 650 aa  133  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.9199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  30.08 
 
 		 598 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  31.54 
 
 		 571 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  29.32 
 
 		 598 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  27.39 
 
 		 599 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  25.81 
 
 		 595 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  31.54 
 
 		 598 aa  133  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.45 
 
 		 655 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  33.88 
 
 		 626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  38.18 
 
 		 665 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.52 
 
 		 592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  25.61 
 
 		 544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  34.59 
 
 		 647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.08 
 
 		 598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  33.69 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  30.82 
 
 		 595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  35.42 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  35.64 
 
 		 669 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.14 
 
 		 663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  34.02 
 
 		 599 aa  131  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  30.9 
 
 		 586 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  30.82 
 
 		 581 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  31.73 
 
 		 1980 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  32.21 
 
 		 581 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>