16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2740 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2740  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1513  hypothetical protein  57.82 
 
 
477 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3161  zinc finger CHC2-family protein  29.81 
 
 
340 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0107  hypothetical protein  30.43 
 
 
344 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0870  hypothetical protein  26.2 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0074  hypothetical protein  27.47 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5407  hypothetical protein  28.89 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1163  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  24.18 
 
 
755 aa  52.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0967  hypothetical protein  24.68 
 
 
933 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739989 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  28.16 
 
 
517 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  25.53 
 
 
517 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0912  DNA primase  25.49 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  32.76 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1276  hypothetical protein  27.55 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  25.52 
 
 
617 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>