26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0912 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0912  DNA primase  100 
 
 		 298 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5169  DNA primase  38.08 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.55186  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  34.52 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1970  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0951482  normal  0.0521635 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7006  hypothetical protein  27.97 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.68287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6337  hypothetical protein  25.41 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  26.45 
 
 		 586 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  26.45 
 
 		 588 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  33.33 
 
 		 626 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  35.94 
 
 		 618 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  23.08 
 
 		 578 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  22.58 
 
 		 609 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  25.4 
 
 		 553 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  27.01 
 
 		 577 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  43.86 
 
 		 647 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  25 
 
 		 596 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  27.01 
 
 		 578 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2740  hypothetical protein  25.49 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  27.16 
 
 		 699 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  23.02 
 
 		 626 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  34.21 
 
 		 564 aa  43.5  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  24.6 
 
 		 572 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 604 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  28.26 
 
 		 601 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  26.71 
 
 		 584 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  24.37 
 
 		 613 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>