23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7006 on replicon NC_013733
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013733  Slin_7006  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.68287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5169  DNA primase  32.8 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.55186  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1970  hypothetical protein  31.78 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0951482  normal  0.0521635 
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  30.65 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0912  DNA primase  27.97 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6337  hypothetical protein  26.69 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  32.8 
 
 		 588 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.43 
 
 		 660 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  33.33 
 
 		 651 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  32.18 
 
 		 618 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  31.82 
 
 		 652 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  29.77 
 
 		 655 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  30.23 
 
 		 655 aa  46.6  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  31.48 
 
 		 559 aa  46.6  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  34.71 
 
 		 660 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  34.71 
 
 		 660 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  34.71 
 
 		 660 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  34.18 
 
 		 609 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  32.26 
 
 		 573 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  39.39 
 
 		 576 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  30.69 
 
 		 596 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  29.77 
 
 		 663 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  31.45 
 
 		 575 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>