13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1970 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0951482  normal  0.0521635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6337  hypothetical protein  41.55 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  35.35 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5169  DNA primase  30.43 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.55186  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7006  hypothetical protein  31.78 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.68287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0912  DNA primase  26.69 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  27.21 
 
 		 601 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  28.08 
 
 		 544 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  52.94 
 
 		 618 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  38.78 
 
 		 634 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  36.73 
 
 		 656 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  43.24 
 
 		 628 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  47.22 
 
 		 655 aa  42.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>