193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0841 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  100 
 
 		 297 aa  618  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0912  DNA primase  34.52 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5169  DNA primase  33.11 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.55186  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1970  hypothetical protein  35.35 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0951482  normal  0.0521635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6337  hypothetical protein  30.2 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7006  hypothetical protein  30.65 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.68287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  32.23 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  31.82 
 
 		 683 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  32.2 
 
 		 656 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  41.89 
 
 		 671 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  31.06 
 
 		 685 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  32.52 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  41.89 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  32.52 
 
 		 634 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  40.54 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  28.87 
 
 		 629 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  31.75 
 
 		 616 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  22.67 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  41.43 
 
 		 647 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  34.85 
 
 		 618 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  30.95 
 
 		 609 aa  56.2  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  28.67 
 
 		 641 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  28.67 
 
 		 641 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  29.33 
 
 		 632 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  29.33 
 
 		 627 aa  55.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  27.97 
 
 		 642 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  30.56 
 
 		 584 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  35 
 
 		 633 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0485  DNA primase  29.5 
 
 		 595 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  30.72 
 
 		 584 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  30.61 
 
 		 584 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  27.81 
 
 		 582 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  27.81 
 
 		 582 aa  53.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  27.81 
 
 		 582 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  31.16 
 
 		 571 aa  53.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  28.93 
 
 		 616 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  26.98 
 
 		 646 aa  53.1  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  32.05 
 
 		 584 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  33.78 
 
 		 586 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  30.56 
 
 		 582 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  30.34 
 
 		 581 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  30.34 
 
 		 581 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  30.34 
 
 		 581 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  30.34 
 
 		 581 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  29.73 
 
 		 583 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  30.34 
 
 		 581 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  29.73 
 
 		 583 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  29.94 
 
 		 586 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  25.42 
 
 		 642 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  32.56 
 
 		 627 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  33.78 
 
 		 588 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2130  DNA primase  30.4 
 
 		 613 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.281855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  35.53 
 
 		 645 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  30.65 
 
 		 629 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  27.2 
 
 		 588 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  36.36 
 
 		 564 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  30.28 
 
 		 581 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  39.51 
 
 		 407 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  26.6 
 
 		 629 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  36.49 
 
 		 639 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  27.59 
 
 		 576 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  29.17 
 
 		 623 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  28.57 
 
 		 704 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  32.26 
 
 		 581 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  28.45 
 
 		 573 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  32.26 
 
 		 581 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  32.26 
 
 		 581 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  32.26 
 
 		 581 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  32.26 
 
 		 581 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.09 
 
 		 581 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  32.26 
 
 		 581 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  32.26 
 
 		 581 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  40.35 
 
 		 652 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  32.26 
 
 		 581 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  24.1 
 
 		 610 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2708  DNA primase  35.38 
 
 		 549 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  28.68 
 
 		 578 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  28.45 
 
 		 575 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  25 
 
 		 517 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  25 
 
 		 918 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  30.89 
 
 		 665 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  31.82 
 
 		 595 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7732  hypothetical protein  46.77 
 
 		 102 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  27.59 
 
 		 601 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  28.28 
 
 		 629 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  30.08 
 
 		 560 aa  49.3  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  26.67 
 
 		 559 aa  49.3  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  42.11 
 
 		 655 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  28.45 
 
 		 574 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  28.45 
 
 		 574 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  31.82 
 
 		 703 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  33.85 
 
 		 576 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  25.87 
 
 		 574 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  34.41 
 
 		 637 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  28.45 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  25.87 
 
 		 574 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  30 
 
 		 530 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  25.87 
 
 		 574 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  25.87 
 
 		 574 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  36.36 
 
 		 641 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>