13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3161 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3161  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 
340 aa  709    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1513  hypothetical protein  30.74 
 
 
477 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2740  hypothetical protein  29.81 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0107  hypothetical protein  26.52 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5407  hypothetical protein  26.52 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0870  hypothetical protein  23.51 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0074  hypothetical protein  24.82 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1163  hypothetical protein  25.87 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  30.95 
 
 
617 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  25.2 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  35.48 
 
 
599 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  26.44 
 
 
646 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  25 
 
 
600 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>