20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0434 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0434  plasmid recombination protein  100 
 
 		 631 aa  1314    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1222  plasmid recombination protein  46.6 
 
 		 413 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000670859  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0039  plasmid recombination enzyme  34.18 
 
 		 395 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0397  plasmid recombination enzyme  34.3 
 
 		 384 aa  110  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0586646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2610  plasmid recombination enzyme  28.42 
 
 		 283 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007104  pE33L5_0003  mobilization protein  28.57 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1109  mobilization protein  30.21 
 
 		 455 aa  98.2  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.831972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0645  plasmid recombination protein  25.7 
 
 		 365 aa  88.2  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0226  recombination protein  31.86 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5034  plasmid recombination enzyme  47.95 
 
 		 129 aa  67  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.937465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2002  hypothetical protein  29.31 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5407  hypothetical protein  26.83 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0074  hypothetical protein  25.42 
 
 		 341 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0107  hypothetical protein  27.35 
 
 		 344 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  26.11 
 
 		 517 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  28.1 
 
 		 918 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1636  hypothetical protein  29.56 
 
 		 196 aa  51.6  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42824  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1163  hypothetical protein  21.62 
 
 		 306 aa  51.2  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  27.45 
 
 		 517 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  23.95 
 
 		 319 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>