13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0039 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0039  plasmid recombination enzyme  100 
 
 		 395 aa  820    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0434  plasmid recombination protein  34.18 
 
 		 631 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1222  plasmid recombination protein  37.14 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000670859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0397  plasmid recombination enzyme  37.8 
 
 		 384 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0586646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2610  plasmid recombination enzyme  30.28 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1109  mobilization protein  26.23 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.831972 
 
 
-
 
NC_007104  pE33L5_0003  mobilization protein  32.29 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0226  recombination protein  25.74 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0645  plasmid recombination protein  27.04 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5034  plasmid recombination enzyme  32.61 
 
 		 129 aa  53.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.937465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2002  hypothetical protein  26.96 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011657  BCAH187_B0003  mob protein  24.31 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011776  BCAH820_A0003  mob protein  24.31 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>