14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6908 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6908  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  433  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204627  normal  0.59164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4187  hypothetical protein  38.96 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.914646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  32.14 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  30.15 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  34.12 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0659794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  35.25 
 
 		 896 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  32.84 
 
 		 276 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  32.84 
 
 		 866 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  24.22 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  24.22 
 
 		 315 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  38.33 
 
 		 288 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  24.62 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2506  hypothetical protein  31.31 
 
 		 358 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  27.03 
 
 		 282 aa  41.6  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.242274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>