26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01337 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  99.64 
 
 		 866 aa  586  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  87.55 
 
 		 896 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2028  exodeoxyribonuclease 8  85.37 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2022  exodeoxyribonuclease 8  84 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1433  exodeoxyribonuclease 8  82.93 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0736689  normal  0.285326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  35.38 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  30.97 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0659794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  27.18 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  26.32 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  26.35 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  27.1 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  27.38 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  29.63 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  29.13 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  27.57 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5093  hypothetical protein  28.64 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6908  hypothetical protein  32.84 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204627  normal  0.59164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  37.18 
 
 		 961 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  37.18 
 
 		 975 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  37.18 
 
 		 975 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  37.18 
 
 		 1062 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  28.64 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  24.48 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.570382 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4221  hypothetical protein  24.03 
 
 		 420 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>