30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1850 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  100 
 
 
270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  37.36 
 
 
896 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  35.38 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  35.38 
 
 
866 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  29.79 
 
 
341 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  31.89 
 
 
331 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0659794 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  28.03 
 
 
301 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  33.12 
 
 
288 aa  94  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  33.14 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  26.9 
 
 
328 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  26.46 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  26.36 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  32.11 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  29.26 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.570382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  29.85 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5093  hypothetical protein  30.73 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  26.32 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6908  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204627  normal  0.59164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  30.38 
 
 
975 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  30.38 
 
 
975 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  30.38 
 
 
961 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  30.38 
 
 
1062 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2022  exodeoxyribonuclease 8  44.16 
 
 
368 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2028  exodeoxyribonuclease 8  44.16 
 
 
315 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1433  exodeoxyribonuclease 8  42.86 
 
 
315 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0736689  normal  0.285326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2490  hypothetical protein  26.29 
 
 
294 aa  55.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.320962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2506  hypothetical protein  24.8 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4187  hypothetical protein  27.53 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.914646  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4234  hypothetical protein  30.88 
 
 
324 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94105  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4221  hypothetical protein  31 
 
 
420 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.723086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>