21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2281 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  33.14 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4234  hypothetical protein  32.82 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2490  hypothetical protein  26.15 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.320962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  27.9 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  26.14 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  25.58 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  26.88 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  26.43 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  25.44 
 
 		 896 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.570382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  25.26 
 
 		 866 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  30.43 
 
 		 975 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  30.43 
 
 		 961 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  30.43 
 
 		 1062 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  30.43 
 
 		 975 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  29.38 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5093  hypothetical protein  28.91 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  28 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4221  hypothetical protein  32.65 
 
 		 420 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>