22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4312 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  716    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  29.79 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  26.28 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  26.48 
 
 		 896 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  27.15 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0659794 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  26.32 
 
 		 866 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  26.32 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  30.4 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6908  hypothetical protein  30.15 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204627  normal  0.59164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  27.8 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  26.55 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  22.18 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4234  hypothetical protein  27.87 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94105  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  28.23 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  28 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  23.77 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.570382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4187  hypothetical protein  22.83 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.914646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1433  exodeoxyribonuclease 8  26.8 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0736689  normal  0.285326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2490  hypothetical protein  22.73 
 
 		 294 aa  42.7  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.320962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5093  hypothetical protein  26.44 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>