41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2294 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  100 
 
 		 866 aa  1808    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3177  exonuclease family protein  74.64 
 
 		 814 aa  843    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000796892  hitchhiker  0.00000000000000114787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  47.56 
 
 		 896 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1822  exonuclease family protein  74.64 
 
 		 771 aa  845    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267479  hitchhiker  0.0000000000000385953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  58.38 
 
 		 813 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  99.64 
 
 		 276 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2022  exodeoxyribonuclease 8  56.45 
 
 		 368 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2028  exodeoxyribonuclease 8  57.68 
 
 		 315 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1433  exodeoxyribonuclease 8  57.05 
 
 		 315 aa  311  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0736689  normal  0.285326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  40.66 
 
 		 975 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  40.91 
 
 		 961 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  40.4 
 
 		 975 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  31.21 
 
 		 1062 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  40 
 
 		 823 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  39.56 
 
 		 823 aa  212  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.07 
 
 		 825 aa  211  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  39.19 
 
 		 823 aa  210  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  38.46 
 
 		 823 aa  204  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  38.46 
 
 		 823 aa  204  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  38.59 
 
 		 825 aa  202  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2287  exonuclease family protein  63.16 
 
 		 460 aa  197  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118532  hitchhiker  0.00000000000465845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  35.38 
 
 		 270 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2083  rac prophage; exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsdna exonuclease  52.31 
 
 		 217 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.182666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  30.6 
 
 		 331 aa  94.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0659794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.49 
 
 		 834 aa  81.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1250  exonuclease family protein  66.67 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693294  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  26.32 
 
 		 341 aa  77.4  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  26.33 
 
 		 328 aa  77.4  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1251  exonuclease family protein  29.41 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  27.34 
 
 		 301 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  27.1 
 
 		 315 aa  73.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  27.38 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  29.63 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  29.13 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  25.26 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  27.91 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5093  hypothetical protein  28.64 
 
 		 320 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6908  hypothetical protein  32.84 
 
 		 206 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204627  normal  0.59164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1133  hypothetical protein  87.5 
 
 		 754 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299719  hitchhiker  1.5018600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  24.65 
 
 		 311 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.570382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  29.13 
 
 		 308 aa  49.3  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>