33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2267 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 834 aa  1720    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1250  exonuclease family protein  47.6 
 
 		 255 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3177  exonuclease family protein  53.4 
 
 		 814 aa  205  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000796892  hitchhiker  0.00000000000000114787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  51.78 
 
 		 823 aa  203  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  53.72 
 
 		 813 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2287  exonuclease family protein  50 
 
 		 460 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118532  hitchhiker  0.00000000000465845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  53.19 
 
 		 825 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  53.19 
 
 		 823 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  53.19 
 
 		 825 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  53.19 
 
 		 823 aa  201  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2299  endodeoxyribonuclease  57.69 
 
 		 189 aa  197  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0895049  hitchhiker  6.23741e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  35.82 
 
 		 961 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  35.53 
 
 		 975 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  44.4 
 
 		 823 aa  193  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  44.4 
 
 		 823 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  35.24 
 
 		 975 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2806  endodeoxyribonuclease  49.45 
 
 		 189 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2635  hypothetical protein  46.52 
 
 		 192 aa  161  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0288656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00846  Endodeoxyribonuclease  46.67 
 
 		 194 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.343412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  37.21 
 
 		 1062 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2743  endodeoxyribonuclease  44.15 
 
 		 186 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628227  hitchhiker  0.000774224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1822  exonuclease family protein  45.64 
 
 		 771 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267479  hitchhiker  0.0000000000000385953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1007  exodeoxyribonuclease VIII  61.73 
 
 		 101 aa  112  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1505  exodeoxyribonuclease VIII  50.47 
 
 		 114 aa  112  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3408  endodeoxyribonuclease  38.17 
 
 		 188 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363386  decreased coverage  0.000737222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  28.92 
 
 		 896 aa  83.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  29.49 
 
 		 866 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1133  hypothetical protein  24.76 
 
 		 754 aa  67.4  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299719  hitchhiker  1.5018600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2253  hypothetical protein  26.32 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000180404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1251  exonuclease family protein  39.13 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2284  exonuclease family protein  36.13 
 
 		 376 aa  62  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506505  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5533  endodeoxyribonuclease  72.41 
 
 		 38 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0669  exonuclease  28.12 
 
 		 188 aa  53.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>