22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2635 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2635  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  396  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0288656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  46.52 
 
 		 834 aa  161  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2299  endodeoxyribonuclease  48.92 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0895049  hitchhiker  6.23741e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  42.39 
 
 		 825 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1250  exonuclease family protein  41.85 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3177  exonuclease family protein  41.49 
 
 		 814 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000796892  hitchhiker  0.00000000000000114787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  41.85 
 
 		 813 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  40.96 
 
 		 823 aa  141  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  41.3 
 
 		 823 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.3 
 
 		 825 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  41.3 
 
 		 823 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2287  exonuclease family protein  40.98 
 
 		 460 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118532  hitchhiker  0.00000000000465845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2806  endodeoxyribonuclease  39.27 
 
 		 189 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  40.22 
 
 		 823 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  40.22 
 
 		 823 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00846  Endodeoxyribonuclease  37.5 
 
 		 194 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.343412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2743  endodeoxyribonuclease  34.95 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628227  hitchhiker  0.000774224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3408  endodeoxyribonuclease  33.86 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363386  decreased coverage  0.000737222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1822  exonuclease family protein  39.67 
 
 		 771 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267479  hitchhiker  0.0000000000000385953 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0669  exonuclease  34.43 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1007  exodeoxyribonuclease VIII  46.43 
 
 		 101 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1505  exodeoxyribonuclease VIII  38.53 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>