35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1745 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  67.92 
 
 		 813 aa  755    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  83.96 
 
 		 823 aa  1442    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  100 
 
 		 823 aa  1714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2284  exonuclease family protein  95.58 
 
 		 376 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506505  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2287  exonuclease family protein  91.94 
 
 		 460 aa  880    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118532  hitchhiker  0.00000000000465845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  83.96 
 
 		 823 aa  1440    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  91.98 
 
 		 823 aa  1578    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  91.38 
 
 		 825 aa  1565    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3177  exonuclease family protein  64.75 
 
 		 814 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000796892  hitchhiker  0.00000000000000114787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  90.17 
 
 		 825 aa  1526    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  94.78 
 
 		 823 aa  1625    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1251  exonuclease family protein  92.75 
 
 		 510 aa  983    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1822  exonuclease family protein  60.12 
 
 		 771 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267479  hitchhiker  0.0000000000000385953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1250  exonuclease family protein  88.24 
 
 		 255 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01545  predicted protein  95.18 
 
 		 168 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000845259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01537  hypothetical protein  95.76 
 
 		 165 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000664873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1505  exodeoxyribonuclease VIII  99.12 
 
 		 114 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2299  endodeoxyribonuclease  58.79 
 
 		 189 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0895049  hitchhiker  6.23741e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1007  exodeoxyribonuclease VIII  96.04 
 
 		 101 aa  211  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  39.19 
 
 		 866 aa  210  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  51.78 
 
 		 834 aa  203  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2806  endodeoxyribonuclease  47.51 
 
 		 189 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2743  endodeoxyribonuclease  41.52 
 
 		 186 aa  150  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628227  hitchhiker  0.000774224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00846  Endodeoxyribonuclease  43.72 
 
 		 194 aa  148  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.343412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2635  hypothetical protein  40.96 
 
 		 192 aa  141  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0288656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3408  endodeoxyribonuclease  38.51 
 
 		 188 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363386  decreased coverage  0.000737222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1133  hypothetical protein  29.56 
 
 		 754 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299719  hitchhiker  1.5018600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  27.34 
 
 		 975 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  27.34 
 
 		 975 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0669  exonuclease  30.99 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2253  hypothetical protein  39.09 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000180404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5533  endodeoxyribonuclease  83.33 
 
 		 38 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  37.25 
 
 		 1062 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  36.27 
 
 		 896 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  77.78 
 
 		 961 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>