30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2287 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  87.58 
 
 		 823 aa  837    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  91.94 
 
 		 823 aa  880    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  80.39 
 
 		 823 aa  777    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2287  exonuclease family protein  100 
 
 		 460 aa  959    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118532  hitchhiker  0.00000000000465845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  80.39 
 
 		 823 aa  776    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3177  exonuclease family protein  89.11 
 
 		 814 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000796892  hitchhiker  0.00000000000000114787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  90.79 
 
 		 813 aa  705    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  87.61 
 
 		 825 aa  842    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  91.96 
 
 		 825 aa  884    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  88.24 
 
 		 823 aa  844    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1822  exonuclease family protein  87.15 
 
 		 771 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267479  hitchhiker  0.0000000000000385953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1250  exonuclease family protein  85.83 
 
 		 255 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1251  exonuclease family protein  87.07 
 
 		 510 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1505  exodeoxyribonuclease VIII  97.35 
 
 		 114 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2299  endodeoxyribonuclease  56.99 
 
 		 189 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0895049  hitchhiker  6.23741e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1007  exodeoxyribonuclease VIII  96 
 
 		 101 aa  209  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  50 
 
 		 834 aa  202  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  63.16 
 
 		 866 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2806  endodeoxyribonuclease  46.96 
 
 		 189 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2743  endodeoxyribonuclease  42.11 
 
 		 186 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628227  hitchhiker  0.000774224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00846  Endodeoxyribonuclease  44.38 
 
 		 194 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.343412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2635  hypothetical protein  40.98 
 
 		 192 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0288656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3408  endodeoxyribonuclease  38.42 
 
 		 188 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363386  decreased coverage  0.000737222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0669  exonuclease  30 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5533  endodeoxyribonuclease  83.87 
 
 		 38 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1133  hypothetical protein  39.51 
 
 		 754 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299719  hitchhiker  1.5018600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  74.07 
 
 		 975 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  74.07 
 
 		 975 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  74.07 
 
 		 961 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  74.07 
 
 		 1062 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>