20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2284 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1251  exonuclease family protein  96.69 
 
 		 510 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  96.96 
 
 		 823 aa  735    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  90.11 
 
 		 825 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  86.5 
 
 		 823 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  91.48 
 
 		 825 aa  691    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2284  exonuclease family protein  100 
 
 		 376 aa  783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506505  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  92.27 
 
 		 823 aa  703    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  95.58 
 
 		 823 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  86.5 
 
 		 823 aa  661    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01545  predicted protein  96.36 
 
 		 168 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000845259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01537  hypothetical protein  96.36 
 
 		 165 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000664873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1133  hypothetical protein  29.28 
 
 		 754 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299719  hitchhiker  1.5018600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  27.49 
 
 		 961 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  27.49 
 
 		 975 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  27.49 
 
 		 975 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2253  hypothetical protein  38.83 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000180404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.13 
 
 		 834 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  40.22 
 
 		 813 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  26.51 
 
 		 1062 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  34.65 
 
 		 896 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>