21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2253 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1133  hypothetical protein  51.82 
 
 		 754 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299719  hitchhiker  1.5018600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2253  hypothetical protein  100 
 
 		 688 aa  1432    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000180404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3410  hypothetical protein  46.76 
 
 		 243 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0362  hypothetical protein  39.23 
 
 		 270 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  40 
 
 		 823 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  40 
 
 		 823 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  28.44 
 
 		 961 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  28.44 
 
 		 975 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  28.44 
 
 		 975 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0205  hypothetical protein  30.33 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1251  exonuclease family protein  38.83 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.32 
 
 		 834 aa  66.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  39.81 
 
 		 823 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  40.66 
 
 		 813 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  39.09 
 
 		 823 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  39.81 
 
 		 823 aa  63.9  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  39.81 
 
 		 825 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.81 
 
 		 825 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2284  exonuclease family protein  38.83 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506505  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  23.75 
 
 		 896 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  24.15 
 
 		 1062 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>