16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5358 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  692    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0659794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  31.89 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  28.31 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  28.01 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  30.6 
 
 		 866 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  30.97 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  27.82 
 
 		 896 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  25.36 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  27.15 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  25.09 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6908  hypothetical protein  34.12 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204627  normal  0.59164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  24.73 
 
 		 307 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  23.64 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.570382 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  26.61 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  29.7 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4187  hypothetical protein  27.86 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.914646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>