13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0667 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.570382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4234  hypothetical protein  33.44 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2490  hypothetical protein  32.35 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.320962 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  27.84 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  29.26 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  26.37 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  26.71 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  23.64 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0659794 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  24.65 
 
 		 866 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  24.48 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  26.67 
 
 		 896 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  23.77 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>