17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5087 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  630  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  34.23 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  33.85 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  28.03 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  26.28 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  25.77 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0659794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  26.35 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  27.34 
 
 		 866 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  25.98 
 
 		 896 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  27.84 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.570382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  25.58 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  23.38 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2490  hypothetical protein  27.23 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.320962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4187  hypothetical protein  23.38 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.914646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6908  hypothetical protein  24.62 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204627  normal  0.59164 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  27.93 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  24.64 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>