12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0978 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  598  1e-170  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  33.12 
 
 
270 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  27.16 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  27.57 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  27.91 
 
 
866 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  25.7 
 
 
896 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  26.61 
 
 
331 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0659794 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  28.23 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  25.64 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  27.78 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6908  hypothetical protein  38.33 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204627  normal  0.59164 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5087  hypothetical protein  27.93 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>