14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4076 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5093  hypothetical protein  80.82 
 
 
320 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2506  hypothetical protein  67.24 
 
 
358 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  47.64 
 
 
308 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2719  hypothetical protein  31.3 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  29.85 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  27.36 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  29.06 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  29.13 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  29.13 
 
 
866 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  27.8 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  29.49 
 
 
896 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  29.38 
 
 
282 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  25.64 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>