13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5093 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5093  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  80.82 
 
 
318 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2506  hypothetical protein  71.07 
 
 
358 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  46.94 
 
 
308 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2719  hypothetical protein  32.58 
 
 
351 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  30.14 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  27.48 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  28.64 
 
 
866 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  26.48 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  28.64 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  29.44 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  27.27 
 
 
896 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  23.93 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>