20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0214 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0214  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1188  hypothetical protein  34.03 
 
 
328 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0597786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2281  hypothetical protein  27.9 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.242274 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  29.2 
 
 
896 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  30.4 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  29.63 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  29.63 
 
 
866 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4234  hypothetical protein  29.12 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94105  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0667  hypothetical protein  26.71 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.570382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  26.32 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4076  hypothetical protein  29.06 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2490  hypothetical protein  24.91 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.320962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1536  hypothetical protein  25.28 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5093  hypothetical protein  28.08 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5046  hypothetical protein  24.81 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0598107  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5358  hypothetical protein  24.73 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0659794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2506  hypothetical protein  25.5 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1550  hypothetical protein  27.45 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0548137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0978  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  hitchhiker  0.00000000101699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2719  hypothetical protein  32.53 
 
 
351 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>