25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1433 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1433  exodeoxyribonuclease 8  100 
 
 		 315 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0736689  normal  0.285326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2028  exodeoxyribonuclease 8  97.46 
 
 		 315 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2022  exodeoxyribonuclease 8  97.46 
 
 		 368 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1383  exonuclease VIII  96.07 
 
 		 896 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167765 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2294  exodeoxyribonuclease VIII  57.05 
 
 		 866 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2083  rac prophage; exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsdna exonuclease  96.91 
 
 		 217 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.182666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01337  hypothetical protein  82.93 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1078  gifsy-1 prophage RecE  37.64 
 
 		 1062 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.673362  decreased coverage  0.00000173114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1046  gifsy-1 prophage RecE  31.64 
 
 		 961 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.74306  decreased coverage  0.00000020097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1822  exonuclease family protein  64.86 
 
 		 771 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267479  hitchhiker  0.0000000000000385953 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3177  exonuclease family protein  64.86 
 
 		 814 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000796892  hitchhiker  0.00000000000000114787 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2842  gifsy-1 prophage RecE  30.1 
 
 		 975 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377327  normal  0.0706472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2289  gifsy-1 prophage RecE  30.1 
 
 		 975 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.164176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1850  exonuclease VIII, 5' -> 3' specific dsDNA exonuclease  42.86 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0122914  hitchhiker  0.0000001977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  36.45 
 
 		 813 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1133  hypothetical protein  91.67 
 
 		 754 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299719  hitchhiker  1.5018600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  76.92 
 
 		 823 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  76.92 
 
 		 825 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  76.92 
 
 		 823 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  76.92 
 
 		 823 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  76.92 
 
 		 825 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  73.08 
 
 		 823 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2287  exonuclease family protein  28.32 
 
 		 460 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118532  hitchhiker  0.00000000000465845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  69.23 
 
 		 823 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4312  hypothetical protein  26.8 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>