More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6913 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6913  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  100 
 
 
219 aa  448  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.32 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.07 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  29.85 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  29.63 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  33.33 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  29.63 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.65 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  24.59 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.5 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.14 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.03 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  32.39 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  25.14 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.14 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.14 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.13 
 
 
257 aa  55.1  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.74 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.14 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  27.91 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  32.53 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  28.68 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.59 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  24.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  24.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  24.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  24.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  34.15 
 
 
357 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  24.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  24.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  24.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.14 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.59 
 
 
220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  29.53 
 
 
257 aa  52  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.59 
 
 
220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
213 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.14 
 
 
264 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  26.14 
 
 
403 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  24.59 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.59 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.23 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.26 
 
 
408 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  43.1 
 
 
398 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.16 
 
 
291 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_002950  PG1486  conjugative transposon protein TraA  28.9 
 
 
269 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.450088 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  27.54 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  30.56 
 
 
345 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.5 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
302 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.5 
 
 
295 aa  48.9  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.5 
 
 
295 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  27.32 
 
 
734 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  43.14 
 
 
402 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.6 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.4 
 
 
405 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.36 
 
 
264 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  38.57 
 
 
265 aa  48.5  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.54 
 
 
310 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  23.08 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  58.97 
 
 
309 aa  48.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 
398 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  43.14 
 
 
397 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.53 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  43.14 
 
 
397 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.66 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  25.93 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  26.15 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.76 
 
 
311 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  29.45 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.51 
 
 
407 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  26.44 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.94 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.43 
 
 
756 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
395 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.14 
 
 
397 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0411  Mrp protein  29.89 
 
 
358 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.41 
 
 
308 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 
273 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  30.4 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  25.25 
 
 
266 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  46.34 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3016  chromosome partitioning ATPase  30.83 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
257 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  31.94 
 
 
217 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  26.67 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  57.5 
 
 
330 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>