31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6861 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  84.27 
 
 
287 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  39.64 
 
 
290 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  39.52 
 
 
295 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  39.3 
 
 
284 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
295 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  37.28 
 
 
282 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  39.7 
 
 
280 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  40 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  36.47 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  37.22 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  33.22 
 
 
280 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  31.21 
 
 
203 aa  119  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  37.24 
 
 
194 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  37.22 
 
 
187 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  37.57 
 
 
176 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  45.04 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  39.73 
 
 
171 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  41.73 
 
 
168 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  38.95 
 
 
166 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  39.37 
 
 
187 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  37.93 
 
 
175 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  38.93 
 
 
184 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  34.22 
 
 
187 aa  96.3  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  40.16 
 
 
195 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  92.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  36.3 
 
 
184 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  38.98 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  31.64 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  28.94 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>