37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6865 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  534  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  85.02 
 
 
259 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  42.34 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  42.57 
 
 
257 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  30.19 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  35.02 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  30.33 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  30.74 
 
 
246 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  30.8 
 
 
234 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  30.96 
 
 
235 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  29.44 
 
 
252 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.41 
 
 
236 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  31.47 
 
 
247 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  31.34 
 
 
238 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  28.97 
 
 
234 aa  99  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  29.72 
 
 
238 aa  99.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  32.57 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  27.31 
 
 
245 aa  89  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  26.07 
 
 
235 aa  79  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  26.51 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  23.55 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  25.44 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.21 
 
 
658 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  28.33 
 
 
639 aa  72  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  25.34 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.34 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  26.15 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  26.51 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  25.75 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.89 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  26.61 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.88 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.79 
 
 
359 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.2 
 
 
359 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.5 
 
 
359 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  27.06 
 
 
378 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  22.86 
 
 
375 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.24806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>