27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6905 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  870    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  87.62 
 
 		 416 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  59.07 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  55.39 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  53.57 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  49.41 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  45.86 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  44.92 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  47.34 
 
 		 425 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  47.26 
 
 		 421 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  44.79 
 
 		 420 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  44.82 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  44.82 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  46.76 
 
 		 440 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  46.65 
 
 		 421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  46.65 
 
 		 421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  43.53 
 
 		 430 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  45.41 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  45.06 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  43.84 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  45.55 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  44.77 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  39.66 
 
 		 407 aa  293  6e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  38.36 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  32.04 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  34.71 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  25.56 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>