86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6859 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  100 
 
 
122 aa  233  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  81.97 
 
 
122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  61.82 
 
 
124 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  56.36 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  58.1 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  58.1 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  55.86 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  53.21 
 
 
108 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  49.15 
 
 
116 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  53.21 
 
 
108 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  53.7 
 
 
108 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  50 
 
 
112 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  52.73 
 
 
115 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  53.77 
 
 
109 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  53.77 
 
 
108 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  50.91 
 
 
109 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  54.72 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  54.72 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  50.93 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  47.27 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  50 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  41.9 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  57.3 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  57.3 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  39.82 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  52 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  51.35 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  43.64 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  40.54 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  43.86 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  48.57 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  42.37 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  42.06 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  42.06 
 
 
136 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  42.06 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  45.36 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  42.59 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  40.19 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  44.74 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  40.57 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  38.79 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  36.75 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  39.13 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  48.78 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  38.53 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  35.2 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  48.05 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  37.39 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  44.58 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  37.38 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4463  hypothetical protein  40.35 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4294  hypothetical protein  40.35 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  40.19 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4194  hypothetical protein  40.35 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6438  hypothetical protein  47.22 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  38.32 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  40 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  42 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  36.45 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  39.25 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  39.45 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  35.45 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  45.19 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  38.53 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  43.12 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5659  hypothetical protein  47.69 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.879701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6407  hypothetical protein  47.69 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00903722  normal  0.080212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  36.54 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  35.65 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  37.14 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2019  protein of unknown function DUF326  41.67 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5433  hypothetical protein  46.15 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31412  normal  0.0551629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  31.82 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2028  hypothetical protein  30.09 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305107  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2900  hypothetical protein  32.46 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0439527 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  34.95 
 
 
119 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  29.89 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  35.85 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  35.16 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  33.9 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  30.49 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37350  hypothetical protein  33 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000234066  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  30.49 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>