2483 genes were found for organism Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rmet_3616  CDS  NC_007974  147614  148003  -  390  osmotically inducible protein  YP_585757  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3617  CDS  NC_007974  153882  154178  +  297  putative excinuclease, subunit C  YP_585758  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3618  CDS  NC_007974  154232  154654  -  423  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  YP_585759  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3619  CDS  NC_007974  154716  155204  -  489  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  YP_585760  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3620  CDS  NC_007974  155450  156913  +  1464  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  YP_585761  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3621  CDS  NC_007974  157139  157462  +  324  hypothetical protein  YP_585762  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3622  CDS  NC_007974  157587  159164  -  1578  major facilitator superfamily transporter  YP_585763  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3623  CDS  NC_007974  159161  159658  -  498  MarR family transcriptional regulator  YP_585764  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3624  CDS  NC_007974  159745  161760  -  2016  hypothetical protein  YP_585765  normal  0.67941  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3625  CDS  NC_007974  161757  162707  -  951  hypothetical protein  YP_585766  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3626  CDS  NC_007974  162795  163721  -  927  putative ATPase  YP_585767  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3627  CDS  NC_007974  163975  164820  +  846  putative deoxygenase  YP_585768  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3628  CDS  NC_007974  164924  165106  -  183  hypothetical protein  YP_585769  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3629  CDS  NC_007974  165316  166056  -  741  GntR family transcriptional regulator  YP_585770  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3630  CDS  NC_007974  166189  167193  -  1005  multidomain oxidoreductase  YP_585771  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3631  CDS  NC_007974  167211  167690  -  480  hypothetical protein  YP_585772  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3632  CDS  NC_007974  167715  169163  -  1449  aldehyde dehydrogenase family protein  YP_585773  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3633  CDS  NC_007974  169239  169955  -  717  transcriptional activator, TenA family  YP_585774  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3634  CDS  NC_007974  170105  171082  -  978  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  YP_585775  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3635  CDS  NC_007974  171303  172841  +  1539  putative transporter  YP_585776  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3636  CDS  NC_007974  172894  173196  +  303  ferredoxin  YP_585777  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3637  CDS  NC_007974  173236  173556  +  321  hypothetical protein  YP_585778  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3638  CDS  NC_007974  173553  173912  +  360  ferredoxin  YP_585779  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3639  CDS  NC_007974  173941  174852  -  912  IclR family transcriptional regulator family  YP_585780  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3640  CDS  NC_007974  175023  175889  +  867  LysR family transcriptional regulator  YP_585781  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3641  CDS  NC_007974  175961  176233  -  273  hypothetical protein  YP_585782  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3642  CDS  NC_007974  176446  177054  -  609  hypothetical protein  YP_585783  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3643  CDS  NC_007974  177147  177656  +  510  MarR family transcriptional regulator  YP_585784  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3644  CDS  NC_007974  177816  178556  +  741  surface antigen precursor  YP_585785  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3645  CDS  NC_007974  178632  179342  -  711  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  YP_585786  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3646  CDS  NC_007974  179530  179949  -  420  hypothetical protein  YP_585787  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3647  CDS  NC_007974  180255  180461  +  207  hypothetical protein  YP_585788  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3648  CDS  NC_007974  180513  182189  -  1677  putative activation/secretion signal peptide protein  YP_585789  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3649  CDS  NC_007974  182341  183924  -  1584  hemagglutinin-related transmembrane protein  YP_585790  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3650  CDS  NC_007974  184430  185659  +  1230  hemagglutinin-related transmembrane protein  YP_585791  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3651  CDS  NC_007974  186104  186295  +  192  Flp/Fap pilin component  YP_585792  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3652  CDS  NC_007974  186633  187094  +  462  putative tight adherence (TadE/G) protein  YP_585793  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3653  CDS  NC_007974  187169  188128  +  960  pilus assembly protein  YP_585794  normal  0.588333  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3654  CDS  NC_007974  188142  189563  +  1422  pilus assembly protein  YP_585795  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3655  CDS  NC_007974  189575  190813  +  1239  pilus assembly protein  YP_585796  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3656  CDS  NC_007974  190815  192131  +  1317  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  YP_585797  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3657  CDS  NC_007974  192121  193050  +  930  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  YP_585798  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3658  CDS  NC_007974  193060  194169  +  1110  type II secretion system protein, transmembrane  YP_585799  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3659  CDS  NC_007974  194170  194991  +  822  flp pilus assembly protein  YP_585800  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3660  CDS  NC_007974  194988  195356  +  369  hypothetical protein  YP_585801  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3661  CDS  NC_007974  195365  197092  +  1728  hypothetical protein  YP_585802  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3662  CDS  NC_007974  197104  198468  +  1365  putative Fis family transcriptional regulator  YP_585803  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3663  CDS  NC_007974  198565  199710  +  1146  dsDNA exonuclease SbcC  YP_585804  normal  0.131633  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3664  CDS  NC_007974  199707  202760  +  3054  dsDNA exonuclease SbcC  YP_585805  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3665  CDS  NC_007974  203005  204441  +  1437  hypothetical protein  YP_585806  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3666  CDS  NC_007974  204661  204945  +  285  hypothetical protein  YP_585807  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3667  CDS  NC_007974  204966  205631  +  666  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  YP_585808  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3668  CDS  NC_007974  205660  206307  +  648  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  YP_585809  normal  0.611031  normal  0.897664  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3669  CDS  NC_007974  206336  207538  +  1203  beta-ketoadipyl CoA thiolase  YP_585810  normal  1  normal  0.486351  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3670  CDS  NC_007974  207798  208529  +  732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_585811  normal  1  normal  0.657002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3671  CDS  NC_007974  208633  209637  +  1005  extra-cytoplasmic solute receptor  YP_585812  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3672  CDS  NC_007974  209834  210043  -  210  hypothetical protein  YP_585813  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3673  CDS  NC_007974  210370  210939  +  570  PadR family transcriptional regulator  YP_585814  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3674  CDS  NC_007974  210973  211962  -  990  2-nitropropane dioxygenase NPD  YP_585815  normal  1  normal  0.955731  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3675  CDS  NC_007974  212143  213219  +  1077  phage integrase / Tyr recombinase protein  YP_585816  normal  1  normal  0.930143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3676  CDS  NC_007974  213312  214331  +  1020  UDP-glucose 4-epimerase  YP_585817  normal  1  normal  0.193812  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3677  CDS  NC_007974  214533  214841  -  309  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  YP_585818  normal  1  normal  0.166379  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3678  CDS  NC_007974  215393  217210  +  1818  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_585819  normal  1  normal  0.12372  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3679  CDS  NC_007974  217347  219329  +  1983  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_585820  normal  1  normal  0.0655415  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3680  CDS  NC_007974  219489  219872  +  384  response regulator receiver domain-containing protein  YP_585821  normal  0.383377  normal  0.047176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3681  CDS  NC_007974  219960  220511  +  552  purine-binding chemotaxis protein  YP_585822  normal  0.501979  normal  0.0481885  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3682  CDS  NC_007974  220629  222287  +  1659  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  YP_585823  normal  1  normal  0.0302709  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3683  CDS  NC_007974  222326  224167  +  1842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_585824  normal  0.755698  normal  0.0578518  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3684  CDS  NC_007974  224276  225028  +  753  hypothetical protein  YP_585825  normal  1  normal  0.0523521  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3685  CDS  NC_007974  225427  225744  +  318  transcriptional activator FlhD  YP_585826  normal  1  normal  0.0479356  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3686  CDS  NC_007974  225741  226346  +  606  transcriptional activator FlhC  YP_585827  normal  1  normal  0.0263324  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3687  CDS  NC_007974  226433  227332  +  900  chemotaxis protein MotA  YP_585828  normal  0.366746  normal  0.0257375  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3688  CDS  NC_007974  227346  228323  +  978  flagellar motor protein MotB  YP_585829  normal  1  normal  0.0125108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3689  CDS  NC_007974  228384  230399  +  2016  CheA signal transduction histidine kinase  YP_585830  normal  0.296916  normal  0.0151662  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3690  CDS  NC_007974  230424  230918  +  495  CheW protein  YP_585831  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3691  CDS  NC_007974  230982  231893  +  912  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  YP_585832  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3692  CDS  NC_007974  231890  232552  +  663  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  YP_585833  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3693  CDS  NC_007974  232620  233693  +  1074  chemotaxis-specific methylesterase  YP_585834  normal  0.0236536  normal  0.0240822  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3694  CDS  NC_007974  233733  234152  +  420  response regulator receiver domain-containing protein  YP_585835  normal  0.0294659  normal  0.0188802  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3695  CDS  NC_007974  234165  234800  +  636  chemotaxis regulator CheZ  YP_585836  normal  0.0568116  normal  0.0208475  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3696  CDS  NC_007974  234929  236287  +  1359  peptidase M20  YP_585837  normal  1  normal  0.0240822  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3697  CDS  NC_007974  236403  237134  +  732  hypothetical protein  YP_585838  normal  1  normal  0.0217939  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3698  CDS  NC_007974  237413  238555  +  1143  flagellar biosynthesis protein FlhB  YP_585839  normal  1  normal  0.0239481  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3699  CDS  NC_007974  238552  240639  +  2088  flagellar biosynthesis protein FlhA  YP_585840  normal  1  normal  0.0172867  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3700  CDS  NC_007974  240649  243126  +  2478  flagellar biosynthesis regulator FlhF  YP_585841  normal  0.528557  normal  0.0206253  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3701  CDS  NC_007974  243130  243954  +  825  flagellar biosynthesis protein FlhG  YP_585842  normal  0.216726  normal  0.0320947  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3702  CDS  NC_007974  244062  244778  +  717  RNA polymerase sigma 28 (sigma F) factor  YP_585843  normal  1  normal  0.0322756  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3703  CDS  NC_007974  244778  245224  +  447  flagellar protein flhE precursor  YP_585844  normal  1  normal  0.0317567  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3704  CDS  NC_007974  245410  246501  -  1092  outer membrane porin  YP_585845  normal  1  normal  0.0181941  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3705  CDS  NC_007974  246580  247605  -  1026  4-oxalomesaconate hydratase  YP_585846  normal  1  normal  0.0366284  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3706  CDS  NC_007974  247602  248750  -  1149  hypothetical protein  YP_585847  normal  1  normal  0.0396378  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3707  CDS  NC_007974  248922  250142  +  1221  LysR family transcriptional regulator  YP_585848  normal  1  normal  0.0214669  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3708  CDS  NC_007974  250312  251637  +  1326  major facilitator superfamily transporter  YP_585849  normal  1  normal  0.0245193  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3709  CDS  NC_007974  251647  252939  +  1293  protocatechuate 4,5-dioxygenase  YP_585850  normal  1  normal  0.0482429  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3710  CDS  NC_007974  252921  253460  +  540  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  YP_585851  normal  1  normal  0.0768491  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3711  CDS  NC_007974  253750  254337  +  588  GNAT family acetyltransferase  YP_585852  normal  1  normal  0.0749115  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3712  CDS  NC_007974  254372  254848  -  477  salicylate 5-hydroxylase (oxygenase small subunit)  YP_585853  normal  1  normal  0.0366284  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3713  CDS  NC_007974  255171  256133  +  963  LysR family transcriptional regulator  YP_585854  normal  1  normal  0.0764365  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3714  CDS  NC_007974  256114  256314  -  201  hypothetical protein  YP_585855  normal  1  normal  0.0621408  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_3715  CDS  NC_007974  256369  256686  -  318  hypothetical protein  YP_585856  normal  1  normal  0.112215  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>