More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3687 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  100 
 
 		 299 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  88.5 
 
 		 287 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  69.12 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  69.12 
 
 		 295 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  69.12 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  66.55 
 
 		 295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 295 aa  401  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  65.26 
 
 		 295 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  65.26 
 
 		 295 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  68.77 
 
 		 298 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  65.26 
 
 		 295 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  66.55 
 
 		 295 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  65.26 
 
 		 295 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  65.26 
 
 		 295 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  65.96 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  65.96 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  64.91 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  65.61 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  66.32 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  65.26 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  66.67 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  65.61 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  63.51 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  63.51 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  63.51 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  63.51 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  63.86 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  70.33 
 
 		 286 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  63.86 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  63.51 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  63.51 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  62.81 
 
 		 286 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  62.81 
 
 		 286 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  63.16 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  65.26 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  60.7 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  60.28 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  60 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  60.56 
 
 		 291 aa  351  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.17 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.1 
 
 		 286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  49.12 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  48.77 
 
 		 301 aa  308  8e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  52.46 
 
 		 289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.45 
 
 		 286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.45 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  51.58 
 
 		 289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.52 
 
 		 286 aa  301  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3227  flagellar motor protein MotA  54.23 
 
 		 284 aa  299  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  51.79 
 
 		 283 aa  296  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  49.28 
 
 		 283 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.16 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  52.3 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  48.75 
 
 		 285 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  54.2 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  51.76 
 
 		 285 aa  285  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  46.26 
 
 		 283 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0722  chemotaxis motA protein  49.3 
 
 		 285 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  48.75 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.7 
 
 		 286 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  47.31 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  47.31 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  47.18 
 
 		 284 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  47.69 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  48.06 
 
 		 283 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  48.06 
 
 		 283 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  47.7 
 
 		 283 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  47.33 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03068  flagellar motor protein MotA  49.26 
 
 		 284 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  45.88 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  45.52 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  45.52 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.57 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  44.94 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.85 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  40.43 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  41.85 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  40.93 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.75 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  42.44 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  43.17 
 
 		 285 aa  221  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  40.78 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  40 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0285898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2951  flagellar motor protein MotA  41.61 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777037  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2179  flagellar motor protein MotA  40.14 
 
 		 282 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4184  flagellar motor protein MotA  39.72 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1260  flagellar motor protein MotA  40.57 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894303  normal  0.516828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>