229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2804 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
296 aa  603  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.66 
 
 
323 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  70.46 
 
 
290 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  70.11 
 
 
290 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0117  flagellar motor protein MotA  69.75 
 
 
339 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  64.75 
 
 
295 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  64.48 
 
 
290 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  63.07 
 
 
301 aa  393  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  63.1 
 
 
290 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0285898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0728  flagellar motor protein MotA  66.43 
 
 
291 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0654  chemotaxis MotA protein  64.31 
 
 
291 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3212  chemotaxis MotA protein  64.44 
 
 
290 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0643  chemotaxis MotA protein  64.31 
 
 
291 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.385067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0622  chemotaxis MotA protein  63.96 
 
 
291 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0250  flagellar motor protein MotA  62.59 
 
 
292 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0249106  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1088  flagellar motor protein MotA  70.15 
 
 
281 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1711  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.35 
 
 
295 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620792  normal  0.172807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.57 
 
 
287 aa  258  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.93 
 
 
312 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  43.59 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  43.59 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  43.59 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  44.69 
 
 
295 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  44.69 
 
 
295 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  44.69 
 
 
295 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  44.69 
 
 
295 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  44.69 
 
 
295 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  45.05 
 
 
295 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  45.05 
 
 
295 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  45.05 
 
 
295 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  45.05 
 
 
295 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  45.05 
 
 
295 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  45.05 
 
 
295 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  45.05 
 
 
295 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  44.69 
 
 
295 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  44.28 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  40.27 
 
 
295 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  41.3 
 
 
295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  41.3 
 
 
295 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  40.34 
 
 
295 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  41.09 
 
 
286 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  41.09 
 
 
286 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.66 
 
 
283 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  44.32 
 
 
295 aa  228  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  39.48 
 
 
283 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  41.18 
 
 
286 aa  225  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  40 
 
 
286 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  39.43 
 
 
286 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  39.43 
 
 
286 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  39.43 
 
 
286 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  39.78 
 
 
286 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  42.35 
 
 
299 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  39.07 
 
 
286 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 
286 aa  221  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  39.07 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  39.07 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  41.16 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  45.59 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.48 
 
 
286 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 
289 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  39.07 
 
 
286 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  39.26 
 
 
290 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 
286 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.86 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  41.58 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  40.15 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  40.07 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  36.68 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  38.1 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  36.43 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  42.12 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  39.05 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4184  flagellar motor protein MotA  39.49 
 
 
288 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.28 
 
 
286 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  41.85 
 
 
285 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2951  flagellar motor protein MotA  38.63 
 
 
289 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777037  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  39.71 
 
 
283 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  37.29 
 
 
301 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  37.29 
 
 
301 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1316  flagellar motor protein MotA  36.59 
 
 
289 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.210771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2976  flagellar motor protein MotA  36.59 
 
 
289 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.749081 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1900  flagellar motor protein MotA  37.69 
 
 
286 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.139415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2749  flagellar motor protein MotA  36.23 
 
 
289 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3227  flagellar motor protein MotA  37.99 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  40.14 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0722  chemotaxis motA protein  37.63 
 
 
285 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2519  flagellar motor protein MotA  39.38 
 
 
290 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1260  flagellar motor protein MotA  37.5 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894303  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  40.07 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>