292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1321 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  100 
 
 
295 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  100 
 
 
295 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  100 
 
 
295 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  100 
 
 
295 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  100 
 
 
295 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  93.56 
 
 
295 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  93.56 
 
 
295 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  93.56 
 
 
295 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  93.56 
 
 
295 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  93.22 
 
 
295 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  93.22 
 
 
295 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  92.88 
 
 
295 aa  564  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  93.56 
 
 
295 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  94.24 
 
 
295 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  82.37 
 
 
295 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  82.37 
 
 
295 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  82.37 
 
 
295 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  80.27 
 
 
298 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  72.2 
 
 
295 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  72.2 
 
 
295 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  71.86 
 
 
295 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  71.19 
 
 
295 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  64.08 
 
 
286 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  64.08 
 
 
286 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  64.08 
 
 
286 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  64.08 
 
 
286 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  64.08 
 
 
286 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  63.38 
 
 
286 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  63.03 
 
 
286 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  63.38 
 
 
286 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  63.16 
 
 
286 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  63.38 
 
 
286 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  63.38 
 
 
286 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  63.73 
 
 
286 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  63.16 
 
 
286 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  63.38 
 
 
286 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  63.38 
 
 
286 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  63.73 
 
 
286 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  63.38 
 
 
286 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  61.75 
 
 
286 aa  384  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  63.03 
 
 
286 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  62.68 
 
 
286 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  63.38 
 
 
286 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  63.03 
 
 
286 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  61.4 
 
 
286 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  66.17 
 
 
299 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  64.21 
 
 
287 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  57.19 
 
 
286 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  59.57 
 
 
293 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  65.31 
 
 
286 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  56.58 
 
 
291 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  55.56 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.82 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  53.31 
 
 
289 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  52.38 
 
 
301 aa  320  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  51.7 
 
 
301 aa  318  6e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.65 
 
 
286 aa  315  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.35 
 
 
286 aa  315  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.7 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  48.94 
 
 
283 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.95 
 
 
286 aa  295  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  49.82 
 
 
290 aa  295  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.12 
 
 
286 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  50.88 
 
 
285 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  50.35 
 
 
286 aa  285  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  46.62 
 
 
285 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3227  flagellar motor protein MotA  49.82 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.7 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  47.69 
 
 
283 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  50.18 
 
 
285 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0722  chemotaxis motA protein  46.13 
 
 
285 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  45.04 
 
 
283 aa  268  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  46.48 
 
 
284 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  43.37 
 
 
283 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.66 
 
 
312 aa  248  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  43.37 
 
 
283 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  44.72 
 
 
283 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03068  flagellar motor protein MotA  46.67 
 
 
284 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.69 
 
 
296 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.14 
 
 
323 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  43.26 
 
 
283 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  43.26 
 
 
283 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  43.32 
 
 
301 aa  238  8e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  42.91 
 
 
283 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  44.24 
 
 
290 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  42.91 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  43.31 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  44.6 
 
 
295 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  42.96 
 
 
283 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  42.55 
 
 
283 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  43.53 
 
 
290 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0285898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.88 
 
 
287 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  41.52 
 
 
290 aa  228  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0117  flagellar motor protein MotA  41.46 
 
 
339 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  43.82 
 
 
284 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  40.83 
 
 
290 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  38.08 
 
 
301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  41.03 
 
 
285 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1435  chemotaxis protein  41.85 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  38.46 
 
 
287 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>