257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4953 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  100 
 
 		 283 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  98.94 
 
 		 283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  89.4 
 
 		 283 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  89.4 
 
 		 283 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  89.4 
 
 		 283 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  89.4 
 
 		 283 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  88.69 
 
 		 283 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  80.57 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  80.57 
 
 		 283 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  77.39 
 
 		 283 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  51.06 
 
 		 283 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  48.75 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  48.75 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  46.81 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  48.39 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  46.85 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  48.23 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  45.58 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  49.12 
 
 		 285 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  46.45 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  44.33 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  48.94 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  45.49 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  43.62 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  47.87 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.16 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  44.37 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  44.37 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  44.37 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  44.37 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  44.1 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  42.4 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  44.01 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  42.2 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  44.01 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  44.1 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  44.01 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  44.01 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  47.12 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  45.63 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  46.47 
 
 		 284 aa  234  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  42.96 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  41.96 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  43.31 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  42.96 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  42.96 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  42.96 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  45.83 
 
 		 291 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  43.11 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  42.31 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  43.11 
 
 		 301 aa  231  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03068  flagellar motor protein MotA  48.88 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.76 
 
 		 286 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  42.25 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  42.25 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  42.25 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  42.25 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  42.25 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  45.99 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  41.9 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  41.9 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3227  flagellar motor protein MotA  43.77 
 
 		 284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  41.55 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  42.7 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1435  chemotaxis protein  46.3 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.96 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  43 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  43.36 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  45.59 
 
 		 286 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2179  flagellar motor protein MotA  41.2 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0722  chemotaxis motA protein  41.4 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3632  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.43 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.189643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.56 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  42.11 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  44.17 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3351  flagellar motor protein MotA  39.51 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0153  flagellar motor protein MotA  41.34 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0201  flagellar motor protein MotA  41.34 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0283  flagellar motor protein MotA  39.16 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0606654  normal  0.545308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0642  flagellar motor protein MotA  41.64 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.509529  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04950  flagellar motor protein MotA  38.35 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  40.64 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  39.93 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0285898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.51 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.65 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  38.03 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>