294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0313 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  96.9 
 
 
290 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0285898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0728  flagellar motor protein MotA  85.17 
 
 
291 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0250  flagellar motor protein MotA  80.14 
 
 
292 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0249106  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  70.17 
 
 
295 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  66.21 
 
 
290 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  65.17 
 
 
290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0117  flagellar motor protein MotA  64.83 
 
 
339 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.48 
 
 
296 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  60.34 
 
 
301 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.7 
 
 
323 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3212  chemotaxis MotA protein  56.21 
 
 
290 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0643  chemotaxis MotA protein  55.17 
 
 
291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.385067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0654  chemotaxis MotA protein  55.17 
 
 
291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0622  chemotaxis MotA protein  54.83 
 
 
291 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1711  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.98 
 
 
295 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620792  normal  0.172807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1088  flagellar motor protein MotA  59.63 
 
 
281 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.96 
 
 
287 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  42.45 
 
 
295 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  42.45 
 
 
295 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  41.13 
 
 
295 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  41.73 
 
 
295 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.09 
 
 
312 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  44.24 
 
 
295 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  44.24 
 
 
295 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  44.24 
 
 
295 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  44.24 
 
 
295 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  44.24 
 
 
295 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  42.09 
 
 
295 aa  234  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  41.16 
 
 
295 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
295 aa  232  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  43.88 
 
 
295 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  42.5 
 
 
286 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  43.88 
 
 
295 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  42.5 
 
 
286 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  43.53 
 
 
295 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  43.53 
 
 
295 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  43.53 
 
 
295 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  43.53 
 
 
295 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  43.53 
 
 
295 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  43.53 
 
 
295 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  41.73 
 
 
286 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  42.03 
 
 
298 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  42.24 
 
 
286 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  41.73 
 
 
286 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  41.37 
 
 
286 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  41.37 
 
 
286 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  41.73 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  41.43 
 
 
286 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 
289 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  41.37 
 
 
286 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  41.37 
 
 
286 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  41.37 
 
 
286 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  41.37 
 
 
286 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  40.43 
 
 
286 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  41.37 
 
 
286 aa  221  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  41.01 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  41.37 
 
 
289 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1900  flagellar motor protein MotA  39.26 
 
 
286 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.139415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  44.96 
 
 
295 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.5 
 
 
286 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  43.43 
 
 
299 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.14 
 
 
286 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  40.7 
 
 
289 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.29 
 
 
286 aa  215  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.29 
 
 
283 aa  214  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  39.3 
 
 
291 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  39.58 
 
 
283 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  39.58 
 
 
283 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  43.33 
 
 
285 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  41.13 
 
 
283 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  40.64 
 
 
283 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  40.64 
 
 
283 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  41.34 
 
 
283 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  43.01 
 
 
287 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  38.38 
 
 
283 aa  208  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.63 
 
 
286 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  41.49 
 
 
301 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  40.28 
 
 
283 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  37.86 
 
 
285 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  40.64 
 
 
283 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  39.78 
 
 
285 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  42.11 
 
 
286 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  40.78 
 
 
301 aa  205  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  35.76 
 
 
293 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  41.43 
 
 
285 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  38.79 
 
 
287 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  39.58 
 
 
283 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.36 
 
 
286 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  39.58 
 
 
283 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  38.85 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  35.25 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>