230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1088 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1088  flagellar motor protein MotA  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.15 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.57 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0117  flagellar motor protein MotA  64.73 
 
 		 339 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  64.73 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  65.43 
 
 		 290 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  63.27 
 
 		 295 aa  359  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3212  chemotaxis MotA protein  64.18 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0654  chemotaxis MotA protein  63.94 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0643  chemotaxis MotA protein  63.94 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.385067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0622  chemotaxis MotA protein  64.31 
 
 		 291 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  59.63 
 
 		 290 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  59.26 
 
 		 290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0285898 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  59.18 
 
 		 301 aa  340  1e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1711  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.21 
 
 		 295 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620792  normal  0.172807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0728  flagellar motor protein MotA  58.67 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0250  flagellar motor protein MotA  58.82 
 
 		 292 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0249106  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.8 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.08 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  41.82 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  41.97 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  41.97 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  44.53 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  44.53 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  44.53 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  44.53 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  44.53 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  42.03 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  41.58 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  40.86 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  42.86 
 
 		 299 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  43.58 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  43.58 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  43.58 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  43.58 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  43.58 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  43.58 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  43.58 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  43.19 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  39.18 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  39.42 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  42.37 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.54 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  39.43 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  40.7 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  37.93 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  41.31 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  41.8 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  40.08 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  38.76 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  38.76 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  37.45 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  39.92 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.09 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  43.36 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  38.37 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  39.92 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.27 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  39.84 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  39.78 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  41.63 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4184  flagellar motor protein MotA  39.92 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  38.65 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.48 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  37.41 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2519  flagellar motor protein MotA  39.77 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1900  flagellar motor protein MotA  38.02 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.139415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.54 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2951  flagellar motor protein MotA  40.52 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777037  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  41.09 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.29 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  38.46 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  38.17 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.54 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  38.82 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  38.08 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3260  flagellar motor protein MotA  39.62 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  37.07 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  37.07 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  37.45 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  37.23 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  36.68 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  37.84 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  36.43 
 
 		 301 aa  181  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  37.45 
 
 		 283 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1435  chemotaxis protein  39.92 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  39.45 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>