246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0622 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0622  chemotaxis MotA protein  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0643  chemotaxis MotA protein  95.19 
 
 
291 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.385067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0654  chemotaxis MotA protein  95.19 
 
 
291 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3212  chemotaxis MotA protein  75.86 
 
 
290 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  64.14 
 
 
290 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.96 
 
 
296 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0117  flagellar motor protein MotA  62.41 
 
 
339 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  62.76 
 
 
290 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.03 
 
 
323 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  61.69 
 
 
295 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  56.9 
 
 
301 aa  357  9.999999999999999e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1711  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.92 
 
 
295 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620792  normal  0.172807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  54.83 
 
 
290 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  53.79 
 
 
290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0285898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0728  flagellar motor protein MotA  57.39 
 
 
291 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1088  flagellar motor protein MotA  64.31 
 
 
281 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0250  flagellar motor protein MotA  55.48 
 
 
292 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0249106  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 
312 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.26 
 
 
287 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  40.58 
 
 
283 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  41.84 
 
 
283 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.21 
 
 
290 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  38.85 
 
 
285 aa  215  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  39.35 
 
 
295 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  39.35 
 
 
295 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  39.35 
 
 
295 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  39.35 
 
 
295 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  39.35 
 
 
295 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.73 
 
 
286 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.38 
 
 
286 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  36.46 
 
 
295 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  36.46 
 
 
295 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  36.46 
 
 
295 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 
289 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  40.35 
 
 
287 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  42.32 
 
 
285 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  37.8 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  37.5 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.79 
 
 
286 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.36 
 
 
286 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  37.91 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  37.91 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  37.91 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  37.91 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  42.4 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  37.91 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  37.91 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  37.91 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  37.91 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  36.93 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  36.14 
 
 
286 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  36.14 
 
 
286 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  35.79 
 
 
286 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  35.74 
 
 
295 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  38.08 
 
 
283 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  35.38 
 
 
286 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  37.72 
 
 
283 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1316  flagellar motor protein MotA  37.86 
 
 
289 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.210771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2976  flagellar motor protein MotA  37.86 
 
 
289 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.749081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  35.25 
 
 
286 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  36.36 
 
 
298 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2519  flagellar motor protein MotA  39.62 
 
 
290 aa  192  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  35.61 
 
 
286 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  40.23 
 
 
286 aa  191  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  34.3 
 
 
295 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  34.42 
 
 
301 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 
286 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1260  flagellar motor protein MotA  39.93 
 
 
287 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894303  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  35.02 
 
 
286 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  38.27 
 
 
295 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  35.38 
 
 
286 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  34.36 
 
 
295 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  35.25 
 
 
286 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  35.25 
 
 
286 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  35.25 
 
 
286 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 
286 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  35.25 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2951  flagellar motor protein MotA  40 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777037  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  38.57 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  38.43 
 
 
286 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  36.65 
 
 
283 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  39.72 
 
 
285 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  34.52 
 
 
295 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  37.18 
 
 
283 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  35.94 
 
 
283 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2749  flagellar motor protein MotA  36.07 
 
 
289 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  35.59 
 
 
301 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  34.89 
 
 
286 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  37.41 
 
 
293 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  37.01 
 
 
283 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0867  flagellar motor protein MotA  36.33 
 
 
289 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  36.3 
 
 
283 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>