293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1411 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  97.9 
 
 		 286 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  97.9 
 
 		 286 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  70.88 
 
 		 286 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  70.42 
 
 		 286 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  70.07 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  70.07 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  70.07 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  70.07 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  70.07 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  69.72 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  70.07 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  70.07 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  70.07 
 
 		 286 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  69.01 
 
 		 286 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  69.37 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  69.72 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  69.72 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  69.01 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  69.37 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  69.37 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  68.31 
 
 		 286 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  69.72 
 
 		 286 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  67.61 
 
 		 286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  65.85 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  65.85 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  65.49 
 
 		 295 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  61.75 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  61.75 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  63.86 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  61.75 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  61.75 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  61.75 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  62.46 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  62.46 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  62.81 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  62.46 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  63.51 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  62.46 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  62.46 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  62.81 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  62.81 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  61.97 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  60.56 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  62.46 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  63.03 
 
 		 298 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  62.46 
 
 		 287 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  64.29 
 
 		 299 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  60 
 
 		 289 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.15 
 
 		 289 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.39 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  59.15 
 
 		 289 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  56.99 
 
 		 301 aa  349  4e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  57.3 
 
 		 293 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  56.29 
 
 		 301 aa  345  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.09 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.74 
 
 		 286 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.09 
 
 		 286 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.71 
 
 		 270 aa  341  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3227  flagellar motor protein MotA  60.56 
 
 		 284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  61.4 
 
 		 286 aa  338  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  61.89 
 
 		 286 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  52.13 
 
 		 285 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  60.07 
 
 		 285 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  55.59 
 
 		 291 aa  319  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.94 
 
 		 286 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  56.94 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0722  chemotaxis motA protein  53.52 
 
 		 285 aa  316  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  53.52 
 
 		 285 aa  315  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  53.38 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  49.46 
 
 		 283 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  50.7 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  46.98 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  51.25 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  50.18 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  48.76 
 
 		 283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.4 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  49.82 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  49.82 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  49.82 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  49.1 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  41.99 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  48.75 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  48.39 
 
 		 283 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03068  flagellar motor protein MotA  49.26 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1435  chemotaxis protein  50 
 
 		 273 aa  255  7e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  47.39 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  47.31 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.4 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  40.79 
 
 		 301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2179  flagellar motor protein MotA  43.06 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0642  flagellar motor protein MotA  41.49 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.509529  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  43.56 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  40.56 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1316  flagellar motor protein MotA  40.78 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.210771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2976  flagellar motor protein MotA  40.78 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.749081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1260  flagellar motor protein MotA  41.61 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894303  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  40.21 
 
 		 287 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  41.43 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4184  flagellar motor protein MotA  39.58 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>