76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3644 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3644  surface antigen precursor  100 
 
 		 246 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  58.94 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  36.32 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  36.32 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  36.32 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  36.32 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  36.32 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  36.32 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  42.37 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  42.37 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  36.32 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  52.5 
 
 		 168 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  52.94 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  43.95 
 
 		 216 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  56.36 
 
 		 167 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  40.8 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  41.45 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  38.36 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  46.75 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  40.8 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  43.15 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  53.1 
 
 		 172 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00385  putative glycin-rich transmembrane protein  56.36 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  42.47 
 
 		 165 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  30.14 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4697  17 kDa surface antigen  63.16 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333957  normal  0.0653539 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3620  17 kDa surface antigen  63.16 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  53.21 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  45.54 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  43.36 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  34.87 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  39.61 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  37.41 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  41.94 
 
 		 175 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  45.71 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  57.14 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  57.14 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  57.14 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  57.14 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  59.52 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  57.14 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  59.52 
 
 		 175 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  31.48 
 
 		 155 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  35.59 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  36.26 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  35.29 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04811  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 159 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  40.24 
 
 		 164 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  64.29 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  43.48 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  64.29 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  46.81 
 
 		 124 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  64.29 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  61.9 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  42.65 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  64.29 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  64.29 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  41.38 
 
 		 166 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10020  hypothetical protein  58.54 
 
 		 527 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  61.9 
 
 		 179 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 257 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  51.02 
 
 		 208 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  55 
 
 		 156 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>