114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3177 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  100 
 
 
164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  57.54 
 
 
186 aa  181  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  50.9 
 
 
165 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  50.9 
 
 
165 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  49.13 
 
 
166 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  50.98 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  46.99 
 
 
185 aa  111  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  35.47 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  42.4 
 
 
272 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  52.13 
 
 
206 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  39.01 
 
 
216 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  39.01 
 
 
215 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  39.01 
 
 
215 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  52.69 
 
 
208 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  42.48 
 
 
216 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  50 
 
 
218 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  42.98 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  50 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  47.42 
 
 
225 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  35.98 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  43.33 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  33.76 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  40.87 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  36.05 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  40.12 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  38.99 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  42.74 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 
247 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  40.8 
 
 
247 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  43.12 
 
 
241 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  43.12 
 
 
241 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  45.3 
 
 
247 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  47.95 
 
 
250 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  42.42 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  47.83 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  37.16 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  42.76 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  51.85 
 
 
294 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  44.93 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  44.3 
 
 
259 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  46.51 
 
 
269 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  51.85 
 
 
280 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  62.79 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  62.79 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  62.79 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  59.52 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  62.79 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  55.77 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  62.79 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  62.79 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  58.82 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  62.79 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  63.41 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  55.77 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  62.79 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  36.08 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  55.77 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  55.77 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  55.77 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  45 
 
 
274 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1451  17 kDa surface antigen  47.92 
 
 
242 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.715937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  35.2 
 
 
208 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  45.37 
 
 
241 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  60.98 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  37.16 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  37.16 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  37.16 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  43.52 
 
 
242 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  36.49 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  43.52 
 
 
242 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  36.49 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  45 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  43.21 
 
 
242 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  43.52 
 
 
242 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 
246 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  36.36 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  42.59 
 
 
251 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 
240 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  42.45 
 
 
251 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2648  17 kDa surface antigen  31.65 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  43.48 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  43.59 
 
 
241 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  43.59 
 
 
241 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  43.59 
 
 
241 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  43.59 
 
 
241 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  43.59 
 
 
241 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  43.59 
 
 
241 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  43.59 
 
 
241 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  41.03 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  28.87 
 
 
124 aa  45.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1310  17 kDa surface antigen  32.9 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.13567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  34.88 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3644  surface antigen precursor  40.71 
 
 
246 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  37.8 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>