84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1003 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 165 aa  324  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  99.39 
 
 		 165 aa  322  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  56.73 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  55.88 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  49.72 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  45.88 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  50.67 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  50.67 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  50.67 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  50.67 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  50.67 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  50.67 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  50.67 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  50.9 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 204 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  55.86 
 
 		 208 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  45.51 
 
 		 215 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  45.51 
 
 		 215 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  45.22 
 
 		 216 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  54.17 
 
 		 272 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  46.67 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  43.68 
 
 		 206 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  48.21 
 
 		 217 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  43.31 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  35.62 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  43.09 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  45.13 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  46.58 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  36.07 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  39.13 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  50.82 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  47.69 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  46.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  49.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  43.66 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  46.03 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 280 aa  51.6  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  44.62 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  35.54 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  52.63 
 
 		 274 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  36.11 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  28.67 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  44.03 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  30.63 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  44.59 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  36.14 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  49.23 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  35.79 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  43.48 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  51.22 
 
 		 257 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  37.23 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  40.7 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  32.67 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  51.22 
 
 		 257 aa  45.1  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  36.91 
 
 		 247 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  30.28 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  36.9 
 
 		 177 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  35.92 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  35.16 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  42.24 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  38.04 
 
 		 179 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  38.04 
 
 		 179 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 147 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  38.04 
 
 		 179 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  38.67 
 
 		 259 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  38.69 
 
 		 250 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  47.62 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2223  17 kDa surface antigen  37.36 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000654513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>