13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0358 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 124 aa  239  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0065  17 kDa surface antigen  82.26 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2590  17 kDa surface antigen  68.55 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1509  17 kDa surface antigen  53.79 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1430  17 kDa surface antigen  52.76 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0937  17 kDa surface antigen  61.05 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4735  17 kDa surface antigen  59.74 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2752  17 kDa surface antigen  60.38 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2328  17 kDa surface antigen  45.35 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470917  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4981  17 kDa surface antigen  33.66 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.932821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1508  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2778  hypothetical protein  32.08 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.832205  normal  0.295065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0299  hypothetical protein  43.64 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>