88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0072 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  43.36 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  41.88 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  41.88 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  41.88 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  41.88 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  41.88 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  41.88 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  41.88 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  40.13 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  40.13 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  37.35 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  43.88 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 272 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  46.15 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  45.21 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  48.51 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  52.94 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  47.22 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  39.82 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  36.81 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3644  surface antigen precursor  53.21 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 217 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  49.54 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  44.14 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  41.91 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00385  putative glycin-rich transmembrane protein  48.15 
 
 		 222 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  42.61 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  45.45 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  39.51 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  42.24 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4697  17 kDa surface antigen  46.4 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333957  normal  0.0653539 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3620  17 kDa surface antigen  46.4 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  47.3 
 
 		 259 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  33.11 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  52.11 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  31.13 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  42.99 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  44.59 
 
 		 274 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  48.21 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  51.16 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  34.93 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  51.16 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  43.1 
 
 		 241 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  43.1 
 
 		 241 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  35.37 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  43.14 
 
 		 242 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  31.13 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0169  hypothetical protein  48 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  31.13 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  43.65 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  29.3 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  42.16 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  42.16 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  42.16 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  42.16 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  30.2 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  42.16 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  42.16 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  42.16 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  40.83 
 
 		 250 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  38.98 
 
 		 247 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10165  conserved histidine-rich protein (AFU_orthologue; AFUA_1G11910)  47.06 
 
 		 260 aa  41.2  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0799455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  31.91 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  43.75 
 
 		 208 aa  40.8  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  41.18 
 
 		 124 aa  40.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  36.96 
 
 		 257 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  36.96 
 
 		 257 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  37.72 
 
 		 247 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  30.82 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>