103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0899 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 167 aa  315  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  85.03 
 
 		 163 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  82.14 
 
 		 168 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  57.23 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  60.13 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  42.21 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  42.21 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  38.93 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  39.86 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  39.86 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  38.76 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  39.86 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  39.86 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  39.86 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  39.86 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  39.86 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  33.68 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  39.01 
 
 		 272 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  51.45 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  40.74 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  34.34 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  47.66 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3644  surface antigen precursor  47.48 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  32.84 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00385  putative glycin-rich transmembrane protein  60.53 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4697  17 kDa surface antigen  51.91 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333957  normal  0.0653539 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3620  17 kDa surface antigen  51.91 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  37.58 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  43.56 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  44.72 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04811  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  32.65 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  60.98 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  45.95 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  31.01 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2648  17 kDa surface antigen  35.4 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.161516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  58.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  60.47 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  58.14 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  40.46 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  41.22 
 
 		 280 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  40.51 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  34.41 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  38.61 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  40.26 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  37.21 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  34.81 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  31.86 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1310  17 kDa surface antigen  36.3 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  36.94 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  33.04 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  40.62 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  48.94 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  53.7 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  60.47 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  31.86 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  30.91 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  36.61 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  34.73 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  34.73 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  34.73 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  34.73 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  34.73 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  35 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  60.47 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  50.94 
 
 		 179 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  32.74 
 
 		 156 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  39.17 
 
 		 247 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2752  17 kDa surface antigen  54.76 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  35.94 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  34.85 
 
 		 241 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  34.85 
 
 		 241 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  37.84 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  37.84 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  37.84 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  29.86 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  38.21 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>