84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5096 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  100 
 
 
190 aa  360  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  44.97 
 
 
186 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  40 
 
 
204 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  45.73 
 
 
218 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  45.73 
 
 
218 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  45.73 
 
 
218 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  45.73 
 
 
218 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  45.73 
 
 
218 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  45.73 
 
 
218 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  45.73 
 
 
218 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  38.86 
 
 
206 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  41.52 
 
 
272 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  53.47 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  37.89 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  37.89 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  39.88 
 
 
164 aa  89  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 
216 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  46.15 
 
 
216 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  40.62 
 
 
185 aa  84.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  46.22 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  42.66 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  36.56 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  45.74 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  38.57 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  41.6 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  44.83 
 
 
168 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  47.13 
 
 
167 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  40 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  45.27 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  42.5 
 
 
269 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  44.3 
 
 
242 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  46.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  46.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  46.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  46.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  46.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  46.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  46.67 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  37.72 
 
 
247 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  36.28 
 
 
234 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  47.22 
 
 
274 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  37.23 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  37.23 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  37.23 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  37.23 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  37.23 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  36.46 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2598  Forkhead-associated protein  57.78 
 
 
350 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  36.46 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  36.36 
 
 
177 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  42.42 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  43.24 
 
 
250 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  36.17 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  54.76 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  36.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  53.19 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  38.16 
 
 
294 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  37.72 
 
 
247 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  39.19 
 
 
280 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  42.67 
 
 
240 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  38.96 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  39.19 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  41.33 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  41.33 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  34.83 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  41.33 
 
 
242 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  40.38 
 
 
685 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  34.38 
 
 
340 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1451  17 kDa surface antigen  40.26 
 
 
242 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.715937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  38.96 
 
 
241 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  55.1 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  55.1 
 
 
179 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  55.1 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.63 
 
 
155 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>